ড. মুঈন উদ্দীন আহমাদ খান চট্টগ্রাম বিশ্ববিদ্যালয়ের ইসলামের ইতিহাস ও সংস্কৃতি বিভাগের ভূতপূর্ব অধ্যাপক, ইসলামিক ফাউন্ডেশন বাংলাদেশ-এর প্রথম মহাপরিচালক, বাংলাদেশ ইন্সটিটিউট অব ইসলামিক থ্যট (বিআইআইটি) এর প্রতিষ্ঠাতা সদস্য এবং সাউদার্ণ বিশ্ববিদ্যালয় বাংলাদেশ-এর প্রতিষ্ঠাতা উপাচার্য।
মৃত্যুর পূর্ব পর্যন্ত তিনি সাউদার্ণ বিশ্ববিদ্যালয়ে সামাজিক বিজ্ঞান, কলা ও আইন অনুষদের ডীন এবং ইসলামিক স্টাডিজ বিভাগের প্রধান হিসেবে দায়িত্ব পালন করেছেন এবং বিআইআইটি’র সিনিয়র একাডেমিক ফেলো হিসেবে গবেষণাকর্মে যুক্ত ছিলেন। তিনি অসংখ্য গ্রন্থ রচনা করেছেন।
তার উল্লেখযোগ্য রচনার মধ্যে রয়েছে- Origin and Development of Experimental Science: A Challenging Encounter With The West (২০২০); Islamic Revivalism: During the 18th, 19th & amp; 20th Centuries (C.E)- In North Africa, Saudi Arabia, Pakistan, India and Bangladesh (২০১০); Muslim Struggle for Freedom in Bengal (১৯৬০), Islam in Bangladesh through Ages (১৯৯৫), Memories of a Lacerated Heart: A War Memoir From East Pakistan to Bangladesh (১৯৭১), Muslim Communities is Southeast Asia (১৯৮০), Titumir and His Followers in British Indian Records (১৯৮০), The Great Revolt of 1867 in India and the Muslims of Bengal (১৯৮৩), History of the Faraidi Movement (১৯৮৪), Social History of the Muslim of Bangladesh (১৯৯২), ফরায়েজী আন্দোলন (১৯৮০), ইসলামে দর্শন চিন্তার পটভূমি (১৯৮০)|